北京科音自然科学研究中心（http://www.keinsci.com）从2015年起举办的各种计算化学培训班以极高的含金量和良心的收费而著称，深受历届学员好评，在计算化学领域内有非常高的知名度和极好的口碑，欢迎进入http://bbs.keinsci.com/forum-43-1.html查看历届培训回顾和学员参后感想，也欢迎进入http://www.keinsci.com/workshop.html了解培训信息。 以下是北京科音近期举办的培训以及未来要举办的培训...

下面是第13001~14000篇使用了笔者开发的功能非常全面而且在世界范围流行的Multiwfn波函数分析程序（//www.umsyar.com/multiwfn）发表的文章的全文pdf合集（其中漏了一篇文章对应的文件，不好找了）。 百度网盘下载地址：https://pan.baidu.com/s/1ZfXjQbQp8zvFMwBs11F3uQ 提取码：w6ri 这些文章的列表见本文末尾，或者看//www.umsyar.com/multiw...

CP2K做杂化泛函计算的关键要点和简单例子 文/Sobereva@北京科音  First release: 2023-Nov-7   Last update: 2023-Nov-15 0 前言 对周期性体系，杂化泛函的计算耗时众所周知远高于纯泛函。著名的第一性原理程序CP2K不光纯泛函的计算超级快，对大体系做杂化泛函计算也非常快（尽管还是远比纯泛函贵），远远快于Quantum ESPRESSO (Q...

2023年10月完结动画简评 文/Sobereva  2023-Oct-30 本文是笔者完整观看过的2023年7月完结的   部全长TV版动画和4部泡面番的简评。注意其中多多少少有一些剧透的成份，怕被剧透又想了解哪些值得追的话就看评分就好了。所有新番笔者都看过前几话（2023年1月开播的番的扫番过程的粗略观感在 里写了），没追的要么是笔者对其题材有抗拒（比如恐怖或者过于低幼），要么就是由于制作质量太差、内容太没创意、剧本...

Multiwfn在Linux下安装的中文说明 文/Sobereva@北京科音   2023-Oct-22 非常流行的波函数分析程序Multiwfn（//www.umsyar.com/multiwfn）在Linux下的安装方法在Multiwfn手册2.1.2节有充分的说明，但我发现老有人不仔细看，或者由于缺乏Linux最基本常识而无法正确follow，还有人因为那是英文就干脆不看而放弃安装。鉴于此，这里用中文完整、详细说一下Mul...

几种基于氨基酸序列构建很简单蛋白质三维结构的工具 文/Sobereva@北京科音   2023-Oct-15 经常有人问已知很简单蛋白质（小肽）的氨基酸序列，怎么得到其三维立体结构，这里就介绍几种工具。本文并不是对相关程序做完整的收集，介绍的这些已经足够满足各种实际情况的需要了。注意本文的范畴和蛋白质结构预测完全不同，那类程序是用于构造有三级结构的较复杂蛋白质用的，本文涉及的工具顶多只牵扯到二级结构。 需要注意的是，只有...

2023年7月完结动画简评 文/Sobereva  2023-Aug-28 本文是笔者完整观看过的2023年7月完结的18部全长TV版动画和1部泡面番的简评。注意其中多多少少有一些剧透的成份，怕被剧透又想了解哪些值得追的话就看评分就好了。所有新番笔者都看过前几话（2023年4月开播的番的扫番过程的粗略观感在http://bbs.keinsci.com/thread-36579-1-1.html里写了），没追的要么是笔者对其题材有抗拒（比如恐...

使用sobEDA和sobEDAw方法做非常准确、快速、方便、普适的能量分解分析 文/Sobereva@北京科音 First release: 2023-Aug-31    Last update: 2023-Sep-24 1 前言 计算化学领域的能量分解分析（energy decomposition analysis, EDA）方法很多，思想各有不同，几种常见的在《Multiwfn支持的弱相互作...

理论设计新颖的基于18碳环构成的双马达超分子体系 文/Sobereva@北京科音   2023-Aug-14 1 前言 北京科音自然科学研究中心（www.keinsci.com）的卢天和江苏科技大学的刘泽玉等人近期设计了由18碳环（cyclo[18]carbon, C18）和具有两个大环的分子（OPP）构成的非常新颖的双马达超分子体系，并做了详细的分子动力学特征的研究，相关工作已发表在知名的Chemical Commu...

使用Multiwfn极为方便地绘制(超)极化率密度和三维空间对(超)极化率的贡献 文/Sobereva@北京科音   2023-Aug-11 1 前言 （超）极化率密度是一种非常重要的直观分析化学体系（超）极化率内在本质的方法，由此可进一步得到三维空间各个位置对（超）极化率的贡献，这种分解分析对于讨论和对比（超）极化率的大小和符号，以及深入了解体系不同区域对外电场的响应，都有重要意义。笔者之前在《使用Multiwfn计算...

使用Multiwfn巨方便地绘制二维NICS平面图考察芳香性 文/Sobereva@北京科音   2023-Aug-9 1 前言 NICS在衡量芳香性上用得很普遍，在《衡量芳香性的方法以及在Multiwfn中的计算》（//www.umsyar.com/176）里有充分介绍，不了解者务必先阅读。强大的波函数分析程序Multiwfn具有很好用的绘制一维NICS图的功能，见《使用Multiwfn绘制一维NICS曲线并通过...

使用Multiwfn绘制一维NICS曲线并通过积分衡量芳香性 文/Sobereva@北京科音  2023-Aug-6 1 关于NICS曲线及其积分 NICS是一种非常流行的基于磁性质衡量芳香性的方法，在《衡量芳香性的方法以及在Multiwfn中的计算》（//www.umsyar.com/176）里有专门的详细介绍，不了解的话务必先阅读此文的相关部分。NICS大多数情况是考察特定点（如环中心或环中心上/下方1埃处）的磁屏蔽情...

辨析计算化学中的任务类型和理论方法 文/Sobereva@北京科音   2023-Aug-5 0 前言 在网上答疑时，偶尔看到有初学者搞不清楚任务类型和理论方法，比如今天有人在思想家公社3号群问“md，aimd和qmmm的区别是啥啊？什么需求下会用到这三种呢？”，这三个词明显都不是一个层面的东西。此文就把计算化学中的任务类型和理论方法的关系明确一下，简明扼要地介绍一下相关基本概念，做一个科普，以令计算化学零基础者一次性搞...

江苏科技大学的刘泽玉等人和北京科音自然科学研究中心的卢天等人近期发表了一篇非常系统性的通过理论计算研究碳链体系的电子光谱文章： Jiaojiao Wang, Zeyu Liu,* Qing Zhou, Tian Lu,* Xia Wang, Xiufen Yan,* Mengdi Zhao, Aihua Yuan, Size dependence of electronic spectrum for H-capped carbon chains, H-(C≡C)n-...

下面是第12001~13000篇使用了笔者开发的功能非常全面而且在世界范围流行的Multiwfn波函数分析程序（//www.umsyar.com/multiwfn）发表的文章的全文pdf合集（其中漏了几篇文章对应的文件，不好找了）。 百度网盘下载地址：https://pan.baidu.com/s/1vbW8R5iSHkeEv2w_hANzaw?pwd=y8gf 这些文章的列表见文件包里的full list.txt，或者看http://sobere...

谈谈重复不出来计算化学文献里的数据的可能原因 文/Sobereva@北京科音   2023-Aug-1 0 前言 经常有做计算化学的人在网上问为什么他没法重复出来文献里的计算数据。导致重复不出来的原因实在太多了，然而初学者提问此类问题时几乎总是含糊其辞，提供的有效信息甚少，导致别人根本无从回复，或者需要别人罗列一大堆可能导致差异的原因。我感到每次回复此类问题太费事，于是在这里专门写个文章说说这事。遇到这种问题的读者仔细...