在VMD中使用GaussView的元素着色的方法
Using GaussView element coloring scheme in VMD
文/Sobereva@北京科音 2022-Sep-16
GaussView的元素配色总体上来说不错,而且对所有元素都定义了唯一的颜色,在File - Preference - Colors - Element Colors中可以看到所有元素的颜色,如下所示
...
详谈使用CP2K产生给Multiwfn用的molden格式的波函数文件
On the using CP2K to generate wavefunction files in molden format for Multiwfn
文/Sobereva@北京科音
First release: 2022-Aug-31 Last update: 2024-Jun-4
0 前言
强大的波函数分析程序Mult...
使用Multiwfn计算特定方向的UV-Vis吸收光谱
Simulating UV-Vis absorption spectrum in specific directions using Multiwfn
文/Sobereva@北京科音
First release: 2022-Jul-8 Last update: 2024-May-14
0 前言
通过
或第一性原理计算,得到理论...
使用Multiwfn对静电势和范德华势做拓扑分析精确得到极小点位置和数值
Using Multiwfn to perform topology analysis for electrostatic potential and van der Waals to exactly obtain positions and values of their minima
文/Sobereva@北京科音 2022-Jul-4
...
使用Multiwfn计算分子和晶体中孔洞的直径
Using Multiwfn to calculate cavity in molecule and
crystal
文/Sobereva@北京科音 2022-Jun-30
0 前言
化学研究中经常涉及到孔洞尺寸的问题,这和分子吸附、化学物质分离、分子识别等很多问题有关。Multiwfn有展现化学体系孔洞并计算其体积的功能,见《使用Multiwfn图形化展...
使用concvar程序求解复杂化学反应中物质的浓度随时间的变化
Using concvar program to solve the change of concentration of substances with time in complex chemical reactions
文/Sobereva@北京科音 (非正式版)
1 前言
最近有人在计算化学公社论坛问“请问常温下像是如下述两条路径的反应,哪个更...
谈谈怎么计算化学体系中“原子的静电势”
On the calculation of "electrostatic potential of atoms" in chemical systems
文/Sobereva@北京科音 2022-May-29
0 前言
在网上经常有人问我怎么计算原子的静电势。“原子的静电势”是一个非常含糊不明的词。静电势是一个三维函数,空间中不同的点有不同的数值,显然静电势不是对...
注:对18碳环另一种重要衍生物C18-Br6的理论研究工作介绍见《不寻常的环[18]碳前驱体C18Br6的电子结构和芳香性》(//www.umsyar.com/664)。
深入揭示18碳环的重要衍生物C18-(CO)n的电子结构和光学特性
Deeply revealing the electronic structure and optical properties of C18-(CO)n, an important derivat...
基于原子电荷极快速绘制超大体系的分子表面静电势图
Extremely fast plotting molecular surface electrostatic potential map of very large systems based on atomic charges
文/Sobereva@北京科音 2022-Apr-13
0 前言
笔者之前写过很多和分子表面静电势分析相关的文章,汇总见ht...
使用CP2K结合Multiwfn绘制密度差图、平面平均密度差曲线和电荷位移曲线
Use CP2K combined with Multiwfn to plot density difference maps, plane averaged density difference curves and charge displacement curves
文/Sobereva@北京科音
First release: 2022-Mar-10&n...