注1:阅读此文不要断章取义。要读就全读完,要么别读。
注2:如果你的目的纯粹是想绘制分子表面静电势填色图,此文是绝对的最佳的做法:《使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图(含视频演示)》(//www.umsyar.com/443),而当前这篇文章就完全没必要看了。
谈谈Molekel做静电势填色等值面图的方法及误区
On the plotting electrostatic potenti...
球谐型与笛卡尔型Gaussian函数的转换关系
Transformation relationship between spherical-harmonic type and Cartesian type of Gaussian functions
文/Sobereva @北京科音 First release: 2011-Jul-31
在笔者的《谈谈5d、6d型d壳层基函数与它们在Gaussian中的标识》...
电子的定域性与相关穴
Localization and correlation hole of electrons
文/Sobereva @北京科音 First release: 2011-Jul-12
1 前言
在《电子定域性的图形分析》(//www.umsyar.com/63)一文中笔者曾对图形化展现电子高定域性区域的方法进行了介绍,在本文中将探讨什么是电子的定域性,并分析它与相关穴之间的关系。在进行更深入的分析之前...
Gaussian中有用的IOp一览
List of useful IOp in Gaussian
文/Sobereva @北京科音
First release: 2011-Feb-2 Last update: 2020-Nov-9
Gaussian中IOp极多,包含了控制程序运行的几乎全部信息,IOp的介绍可参考笔者的《Gaussian的Link、IOp与非标准计算路径》(//www.umsyar.com/57)。大部分重要、常...
Mayer能量分解及APEX4程序使用简介
Introduction to Mayer energy decomposition and the use of APEX4 program
文/Sobereva @北京科音
First release: 2011-Jun-7 Last update: 2020-Jul-15
1 前言
目前已有一大批能量分解方法,用于将相互作用能拆成各个成分,如Morokuma方法、Ziegler-...
数值误差对计算化学结果重现性的影响
The impact of numerical errors on the reproducibility of computational chemistry results
文/Sobereva @北京科音
First release: 2011-May-25
1 前言
曾经有很多人问,诸如为什么明明输入文件一样,但是动力学轨迹每次跑出来的都不一样、为什么几何优化结果相差甚远等等,甚至怀疑计算科学是否遵循决定论...
制作动画分析电子结构特征
Creating animations to analyze electron structure characteristics
文/Sobereva @北京科音
First release: 2011-May-1 Last update: 2014-Apr-15
在《自写Link生成Gaussian的IRC任务中每个点的波函数文件》(//www.umsyar.com/8...
自写Link生成Gaussian的IRC任务中每个点的波函数文件
Write an own Link to generate wavefunction file for each point of IRC task of Gaussian
文/Sobereva 2011-Apr-24
1 前言
在Gaussian的IRC任务,以及scan、优化等任务中,只有最后一步波函数才允许在任务结束时被l9999输出为PROAIM波函数...