能绘制原子球上带十字形线的分子结构图的几种软件和用法
Several software that can draw molecular structure maps with cross-shaped lines on atomic spheres
文/Sobereva@北京科音 2012-Jul-7
1 关于椭球图和十字形线
经常看到有人问用什么可视化软件可以让显示的分子结构图上每个原子上有个十字形线...
CFOUR程序的编译和使用方法简介
An introduction to compiling and using the CFOUR program
文/Sobereva @北京科音 2012-Jul-5
1 前言
CFOUR程序的全称是Coupled-Cluster techniques for Computational Chemistry。它是由ACESII-MAB程序改名而来,而ACESII-MAB程序...
注:后来发布了AICD 2.0,安装和使用比此文介绍的老版本方便得多,因此一定要看此文:《使用AICD 2.0绘制磁感应电流图》(//www.umsyar.com/294)
使用AICD程序研究电子离域性和磁感应电流密度
Study of electron delocalization and magnetically induced current density using AICD program
文/Sobereva ...
2023-Jun-3注:笔者后来又写了《基于Gaussian的NMR=CSGT任务得到各个轨道对NICS贡献的方法》(//www.umsyar.com/670)介绍另一种分解NICS的方法,可以得到各个分子轨道的贡献,只需要用Gaussian而不依赖于NBO
将核独立化学位移(NICS)分解为sigma和pi轨道的贡献
Decomposition of nuclear independent chemical shift (NICS) into c...
编译NBO5.0独立运行版和嵌入Gaussian03 C02版的方法
Method to compile NBO5.0 standalone version and the version embedded in Gaussian03 C02
文/Sobereva @北京科音 2012-May-30
NBO程序有两种运行模式,一种是独立运行版,称GENNBO,也叫standalone版。一种是作为模块嵌入进其它大型量...
将Material Studio的xtd轨迹文件导出为xyz轨迹文件的方法
The way to export xtd trajectory file of Material $tudio to xyz trajectory file
文/Sobereva @北京科音 First release: 2012-May-23
Material Studio(MS)的xtd文件包含了原子或者粗粒化模拟中的bead的轨迹信息。这是MS的...
后记:Multiwfn从3.4版开始支持了轨道定域化功能,如果没有离域范围很大的AdNDP轨道时可以直接代替AdNDP分析,结果基本相同,但用起来方便得多,详见《Multiwfn的轨道定域化功能的使用以及与NBO、AdNDP分析的对比》(//www.umsyar.com/380)。
使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键
Study multi-center bonds by AdNDP approach as well as ...
2019-Mar-3注:在文末补充了全新的测试,以反映目前主流硬件下的情况
首个完全基于GPU的量化软件-TeraChem杂谈及真实性能测试
The first completely GPU-based quantum chemistry software: Comment and real performance test
文/Sobereva 2012-Apr-30
TeraChem是第一个公布于世...