能绘制原子球上带十字形线的分子结构图的几种软件和用法

能绘制原子球上带十字形线的分子结构图的几种软件和用法 Several software that can draw molecular structure maps with cross-shaped lines on atomic spheres 文/Sobereva@北京科音  2012-Jul-7   1 关于椭球图和十字形线 经常看到有人问用什么可视化软件可以让显示的分子结构图上每个原子上有个十字形线...

CFOUR程序的编译和使用方法简介

CFOUR程序的编译和使用方法简介 An introduction to compiling and using the CFOUR program 文/Sobereva @北京科音  2012-Jul-5 1 前言 CFOUR程序的全称是Coupled-Cluster techniques for Computational Chemistry。它是由ACESII-MAB程序改名而来,而ACESII-MAB程序...

适合理论、计算化学投稿的期刊及其2011年影响因子

适合理论、计算化学投稿的期刊及其2011年影响因子 文/Sobereva @北京科音  2012-Jun-29 2009年的影响因子见//www.umsyar.com/92 2010年的影响因子见//www.umsyar.com/64 很多其它期刊中也零零散散有一些理论、计算化学类文章,就不列出了,免得列表冗杂且缺乏重点。期刊名称是标准缩写,括号里面是常用简称或者全名,之后是ISSN号。斜杠前是2011年的两年期影响因子(即一般所谓的影响因子。是2...

Utilizing AICD and GIMIC programs to study magnetically induced current density (幻灯片)

这是洒家(sobereva)做的一个幻灯片,介绍了感应电流密度,以及使用AICD和GIMIC程序计算感应电流密度的方法 下载地址:/usr/uploads/file/20150609/20150609155327_57037.ppt 注意,此幻灯片对应的是AICD和GIMIC的老版本,后来两个程序都出了好用得多的新版本,所以操作部分应当参考以下两篇文章 考察分子磁感生电流的程序GIMIC 2.0的使用(含24分钟演示视频) htt...

使用AICD程序研究电子离域性和磁感应电流密度

注:后来发布了AICD 2.0,安装和使用比此文介绍的老版本方便得多,因此一定要看此文:《使用AICD 2.0绘制磁感应电流图》(//www.umsyar.com/294) 使用AICD程序研究电子离域性和磁感应电流密度 Study of electron delocalization and magnetically induced current density using AICD program 文/Sobereva ...

夏色奇迹百合文:盛夏的梦

盛夏的梦 文/Sobereva  2012-May-29 一 优香的家里是开旅馆的,虽然每年夏天的旅游旺季优香都被姐姐勒令帮忙干活,却都被优香逃掉了。然而今年,自从一个在本地取材的名为《花开物语》的动画开播后,旅馆预定数突然暴增,人手是真的不够了。 “优香,你也看见了,最近咱家旅店的服务员已经忙不过来了,你也别闲着了,从明天开始你也得干活,绝对不许逃了,听见了没?”这次姐姐说话的语气比以前都认真,优香觉得确实有点不妙。 ...

将核独立化学位移(NICS)分解为sigma和pi轨道的贡献

2023-Jun-3注:笔者后来又写了《基于Gaussian的NMR=CSGT任务得到各个轨道对NICS贡献的方法》(//www.umsyar.com/670)介绍另一种分解NICS的方法,可以得到各个分子轨道的贡献,只需要用Gaussian而不依赖于NBO 将核独立化学位移(NICS)分解为sigma和pi轨道的贡献 Decomposition of nuclear independent chemical shift (NICS) into c...

编译NBO5.0独立运行版和嵌入Gaussian03 C02版的方法

编译NBO5.0独立运行版和嵌入Gaussian03 C02版的方法 Method to compile NBO5.0 standalone version and the version embedded in Gaussian03 C02 文/Sobereva @北京科音   2012-May-30 NBO程序有两种运行模式,一种是独立运行版,称GENNBO,也叫standalone版。一种是作为模块嵌入进其它大型量...

将Material Studio的xtd轨迹文件导出为xyz轨迹文件的方法

将Material Studio的xtd轨迹文件导出为xyz轨迹文件的方法 The way to export xtd trajectory file of Material $tudio to xyz trajectory file 文/Sobereva @北京科音  First release: 2012-May-23 Material Studio(MS)的xtd文件包含了原子或者粗粒化模拟中的bead的轨迹信息。这是MS的...

幻想乡开放日杂谈和现场演出录像

幻想乡开放日杂谈和现场演出录像 文/Sobereva(3)  2012-May-21 先不说别的,看一段这次幻想乡开放日的现场演出视频吧,东方众熟知的《全人類ノ非想天則》和《幻想万华镜》的神级sax演出,真心觉得碉堡!这位形似土狼的大叔我已经在五花八门的漫展上见过N次,但这回,我才知道此人真乃人才! 幻想乡开放日于2012年5月20日在帝都朝阳区东三环三元西桥曙光里小学贝特羽毛球馆举行,是去年次元震荡漫展的那批人办的。此漫展主题还是有一定创意的,也就...

Fate/Zero百合文:Equilateral triangle(SaberX舞弥X爱丽丝菲尔)

Fate/Zero百合文:Equilateral triangle 文/Sobereva  2012-May-20 一 舞弥与爱丽丝菲尔 我,久宇舞弥,从小被当做一个武器和泄欲的工具被养大,组成我生命的只有杀戮和痛苦的煎熬。直到卫宫切嗣将我救出的那一天开始,我仿佛才第一次有了意识和情感。 爱丽丝菲尔是为了圣杯战争而通过魔术制造的人偶,她表面上与人类没有任何不同,名义上是切嗣的夫人。每当爱丽丝菲尔单独出行时,切嗣总是让...

第5届临界同人漫展收获和cosplay照片

第5届临界同人漫展收获和cosplay照片 文/Sobereva(3)  2012-May-13 第5届临界同人漫展于2012年5月13日在中国人民大学篮球场举行。这回临界同人与往届最大的不同,应该就是没有专门的cosplay演出了,只有漫展部分。话说,第4届的演出彻底搞砸了,要是早知那样我都不去了。而这次取消据说是因为人大的场馆由于涉及到某些违规,暂时没法正常使用所致。希望下一届还能恢复,这种综合性的cosplay演出也算是临界同人最大的特色...

存在感最低的漫展--GTV“lim2.5 D”夏日学园祭游记

存在感最低的漫展--GTV“lim2.5 D”夏日学园祭游记 文/Sobereva(3) 2012-May-7 lim2.5D漫展于2012年5月6日在北京朝阳传媒影视技术服务中心一层举办。这个漫展是我去过的,最最坑爹的漫展,没有之一。展馆位置实在是太隐蔽了,在官方页面说的大黄庄下了公交车,顶着烈日在附近来回走了一个多小时才终于找到场馆!一度令我以为这个漫展是不是临时取消了,毕竟这漫展不收门票钱也不收摊位费,而且是第一次办,地点很不知名,临开展差不多一个...

使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键

后记:Multiwfn从3.4版开始支持了轨道定域化功能,如果没有离域范围很大的AdNDP轨道时可以直接代替AdNDP分析,结果基本相同,但用起来方便得多,详见《Multiwfn的轨道定域化功能的使用以及与NBO、AdNDP分析的对比》(//www.umsyar.com/380)。 使用AdNDP方法以及ELF/LOL、多中心键级研究多中心键 Study multi-center bonds by AdNDP approach as well as ...

首个完全基于GPU的量化软件-TeraChem杂谈及真实性能测试

2019-Mar-3注:在文末补充了全新的测试,以反映目前主流硬件下的情况 首个完全基于GPU的量化软件-TeraChem杂谈及真实性能测试 The first completely GPU-based quantum chemistry software: Comment and real performance test 文/Sobereva   2012-Apr-30 TeraChem是第一个公布于世...
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