杂谈Multiwfn从1.0到3.0版的开发经历
Talking about the development experience of Multiwfn from version 1.0 to version 3.0
文/Sobereva @北京科音 2013-Mar-29
在Multiwfn 3.0发布后,在疲惫、激动之余,回想起从Multiwfn 1.0到3.0版这三年多...
使用Multiwfn做电子密度、ELF、静电势、密度差等函数的盆分析
Using Multiwfn to perform basin analysis for electron density, ELF, electrostatic potential, density difference and other functions
文/Sobereva @北京科音
First release: 2013-Mar-27 Last u...
调节平面分子间距的方法
The method to adjust the distance between planar molecules
文/Sobereva@北京科音 2013-Feb-3
计算化学研究中有时需要调节两个平面分子间距离,比如研究不同间距下的相互作用能。如果两个平面分子的坐标正好对着,或者分子平面平行于某个笛卡尔平面,那么改变间距很容易。前者就用gview的设定键长大小的工具就能调,后者就自行对笛卡尔坐标统一加减一定的数...
后记:此文用VMD的做法已经没有意义了,用Multiwfn来实现方便得多!仔细看《Multiwfn中非常实用的几何操作和坐标变换功能介绍》(//www.umsyar.com/610)中的介绍,特别是2.3节的例子。
让指定化学键平行于笛卡尔坐标轴的方法
Method to make specific chemical bond parallel to a Cartesian coordinate axis
文/Sobereva@北京科...
补充:在此文撰文之后Multiwfn又支持了ICSS方法图形化分析芳香性,极具实用价值,见《通过Multiwfn绘制等化学屏蔽表面研究芳香性》(//www.umsyar.com/216)。
补充:后来Multiwfn支持了对周期性体系考察芳香性,详见《使用Multiwfn考察周期性体系的芳香性》(//www.umsyar.com/722)。
衡量芳香性的方法以及在Multiwfn中的计算
The methods for measuring...
谈谈能量的基组外推
On the basis set extrapolation of energy
文/Sobereva @北京科音
First release: 2012-Dec-30 Last update: 2017-Jun-8
1 前言
计算中一个主要的误差来源是基组不够大,或者说距离完备基组极限差距较大。用越大的基组计算耗时越多。对于一些性质,如能量、优化出的结构、偶极矩等,...
注:ChimeraX是Chimera的后继版,显示效果有了显著提升,而且界面更友好。我专门录了ChimeraX绘制本文所示图像的演示视频,看https://www.bilibili.com/video/av85684420或 https://youtu.be/vC48iEB8PwI。
在Chimera中用不同的颜色显示不同的等值面
Display different isosurfaces with different colors in Chimera...
Multiwfn入门tips
Tips for getting started with Multiwfn
文/Sobereva @北京科音
First release: 2012-Nov-7 Last update: 2024-Aug-28
0 前言
Multiwfn(主页为//www.umsyar.com/multiwfn)是由北京科音自然科学研究中心(www.keinsci.com...