DFT交换相关泛函库的使用方法
The use of DFT exchange-correlation functional libraries
文/Sobereva @北京科音
First release: 2013-Nov-10 Last update: 2019-Feb-10
1 前言
DFT大行其道的今天,写
程序总是免不了要涉及DFT计算,而DFT的核心就是交换相关...
注:本文主要讲DFT-D3。笔者后来又写了文章专门介绍DFT-D4,见《DFT-D4色散校正的简介与使用》(//www.umsyar.com/464)。
DFT-D色散校正的使用
Use of DFT-D dispersion correction
文/Sobereva @北京科音
First release: 2013-Nov-7 Last update: 2024-Apr-8
1 ...
静电效应主导了氢气、氮气二聚体的构型
Electrostatic effect dominates the configuration of hydrogen and nitrogen dimers
文/Sobereva @北京科音 2013-Nov-6
氢气和氮气分子是最基本、最简单的无极性分子。由于没有极性,所以人们普遍认为由它们构成的二聚体(H2)2、(N2)2和(H2)(N2)都是范德华二聚体,也就是分子间相互作用纯粹靠范...
GAPT电荷的原理和性质
The principles and properties of GAPT charges
文/Sobereva @北京科音 2013-11-5
在《物理化学学报》上有一篇《原子电荷计算方法的对比》(2012, 28, 1-18,http://www.whxb.pku.edu.cn/CN/abstract/abstract27818.shtml),简要介绍并详细比较了诸...
注:强烈建议读者先阅读笔者后来写的《使用Multiwfn+VMD快速地绘制高质量AIM拓扑分析图》(//www.umsyar.com/445),其中将本文的操作过程通过脚本极大地简化,只需要不到1/20的时间就可以绘制出本文相同效果的图像。
Multiwfn结合VMD绘制AIM拓扑分析图
Drawing AIM topological analysis diagram by combinely using Multiwfn and VMD
...
研究波函数分析的主要人物一览
List of known people in the field of wavefunction analysis
文/Sobereva @北京科音
First release: 2013-Sep-28 Last update: 2023-Jul-19
很多人对波函数分析十分陌生,误以为是个极为小众向的领域,导致本人时常被问及当今研究波函数分析的主要人物都有哪些。实际上做波函数分析的...
通过键级曲线和ELF/LOL/RDG等值面动画研究化学反应过程
Studying chemical reaction process via curve map of bond order and anime of ELF/LOL/RDG isosurface
文/Sobereva @北京科音 2013-Sep-11
很久很久以前,寡人写过一篇帖子名为《制作动画分析电子结构特征》(//www.umsyar.com/86)。在...
产生Gaussian的IRC和SCAN任务每个点的波函数文件的工具:IRCsplit和SCANsplit
IRCsplit and SCANsplit: Tools to generate wavefunction file for each point of IRC and SCAN tasks of Gaussian
文/Sobereva @北京科音
First release: 2013-Sep-9 Last update: 2...
在VMD中显示原子序号的方法
The way of displaying atomic index in VMD
文/Sobereva@北京科音
First release: 2013-Jul-30 Last update: 2014-Jul-23
VMD虽然灵活强大,但是却没有提供一般的分子可视化软件的直接显示全部原子序号的功能,比较不方便。但是这也可以手动或者通过脚本来实现。
手动实现的办...