注:笔者后来开发了genmixmem,可以实现genmem的所有功能,还能生成混合膜,因此genmem已没有存在意义了。见《生成混合组分的磷脂双层膜结构文件的工具genmixmem》(//www.umsyar.com/245)
生成磷脂双层膜结构文件的小工具genmem
genmem: A small tool that generates phospholipid bilayer membrane structure files
文/Sober...
谈谈谐振频率校正因子
Introduction to the scale factor of harmonic frequencies
文/Sobereva @北京科音
First release: 2014-Jan-19 Last update: 2020-May-17
1 频率校正因子的基本知识
通常理论计算的频率是谐振频率,由于忽视了非谐振效应,而且理论方法本身也有误差,所以直接基于它计算基频、零点能、焓、熵都可...
一些波函数分析词汇的中文翻译
Chinese translation of some wavefunction analysis vocabulary
文/Sobereva @北京科音
First release: 2014-Jan-16 Last update: 2014-Mar-4
由于波函数分析方面目前没有中文的专著,很多波函数分析方法甚至从未在中文文献中出现过,导致有些人在写中文论文时遇到困难,不知道怎么翻译波函数分析当中的词汇。...
PM7、PM6-DH+半经验方法在优化碱基对儿时的失败
Failure of PM7 and PM6-DH+ semi-empirical methods in optimizing base pairs
文/Sobereva @北京科音
First release: 2013-Dec-30 Last update: 2015-Jul-18
已在《大体系弱相互作用计算的解决之道》(//www.umsyar.com/214)...
大体系弱相互作用计算的解决之道
Solutions to the calculation of weak interactions in large systems
文/Sobereva @北京科音
First release: 2013-Dec-18 Last update: 2018-Jun-3
1 前言
以DFT-D为代表的一大类色散校正方法使得大体系弱相互作用的计算成为了可能,介绍和使用见《DFT-D色散校...
LACVP这类方式命名的基组的含义
The meaning of basis sets named in such a way as LACVP
文/Sobereva @北京科音
First release: 2013-Nov-16 Last update: 2018-Oct-17
这类基组的命名是来自Jaguar程序,详见Jaguar手册。它们都是混合基组,对轻原子用全电子基...
mopac2xyz:将MOPAC的几何优化过程转换为xyz轨迹文件的工具
mopac2xyz: A tool to convert geometry optimization process of MOPAC program into xyz trajectory file
文/Sobereva @北京科音
First release: 2013-Nov-12 Last update: 2021-Sep-20
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