注：GROMACS通常在Linux下运行，本文只讲在Linux下的编译和安装方法。GROMACS在Windows下也照样可以完美编译和运行，参见《GROMACS的原生Windows版的编译和安装方法》（//www.umsyar.com/458），里面还提供了笔者编译好的Windows版。 GROMACS的安装方法 Installation method of GROMACS 文/Sobereva@北京科音 F...

2018年下半年观看的非TV版动画简评 文/Sobereva  2019-Jan-1 以前Sobereva只写观看了的TV版动画评论，但是我看的OVA、OAD、SP、剧场版等额外形式的动画也不少，不写评论可惜了，因此这里对从2018年9月15日开始截止到2018年12月31日观看的非TV版动画也都进行简单评论，以后也会一直写此类评论。还有些此类动画看完后忘写了，就也不再补了。由于这类动画不好对比和打分，我也就不给出评分了。 牵...

VASP的最简单的安装方法 The simplest way to install VASP 文/Sobereva@北京科音   2019-Jan-1 目前计算化学公社论坛（http://bbs.keinsci.com）上的第一性原理板块里已经有多篇写得很好的关于VASP的编译方法的帖子了。笔者这里写一个初学者最易于理解的版本，不仅所需要的操作步骤是最少的，而且编译出来的VASP运行效率几乎是最高的。考虑到少数读者可...

视频地址：https://www.bilibili.com/video/av39555524/  因为给别人解释怎么安装计算化学程序的时候，对方有极大概率是Linux零基础，不知道系统怎么装，或者装了也是瞎装，故录此视频。完全Linux零基础的人严格照着此视频也可以顺利安装最适合计算化学工作者使用的CentOS。本视频虽然用的是VMware装的，但对于实体计算机，只要把镜像烧到U盘或光盘并由其启动，之后的安装过程和视频里完全一样，只不过应在安装界面里根据实际情况对硬盘进行分区。笔...

使用CYLview绘制高质量分子结构图和制作化学反应演示动画 Using CYLview to plot high-quality molecular structure maps and create chemical reaction demonstration animations 文/Sobereva@北京科音 2018-Dec-26 CYLview的虽然功能不算多强大，但它在作图的很多特性方面没有其它程序能很好取代，...

Multiwfn FAQ 文/Sobereva@北京科音  First release: 2018-Dec-24   Last update:  2024-Jun-19 波函数分析程序Multiwfn（//www.umsyar.com/multiwfn）如今已十分流行，本文针对用户常问的问题进行统一解答，也推荐所有Multiwfn用户完整阅读此文！此文会经常更新。本文分为四部分：(1)常识性...

程序ORCA的安装方法 Installation method of ORCA quantum chemistry program 文/Sobereva@北京科音 First release 2018-Dec-21  Last update: 2023-Oct-19 0 前言 ORCA是一款对学术用户免费但不开源的 程序，发展迅猛，流行程度越来越高，用户越来越多。虽然ORCA的安装很简单，都不需要编译...

为什么我极度鄙视和厌恶百毒 Why do I despise and hate Baidu so much? 文/Sobereva  First release: 2018-Dec-3  Last update: 2020-Oct-25 我对百毒的鄙视和厌恶由来已久，早就想写此文，但一直没空。正好昨天有个人在我的一个两千多人的专业的科研群里大肆鼓吹使用百毒、百毒学术、百毒文库，结果被笔者和群友一通批判。我...

注：本文的操作配有演示视频，请注意观看，五分钟就能学会画出本文里面的图像的效果，见https://www.bilibili.com/video/av37101659/ 用VMD绘制艺术级轨道等值面图的方法 Method of drawing state-of-the-art orbital isosurface map using VMD 文/Sobereva@北京科音 First release: 2018-N...

Multiwfn支持的电子激发分析方法一览 An overview of electron excitation analysis methods supported by Multiwfn 文/Sobereva@北京科音 First release: 2018-Nov-14  Last update: 2022-Mar-1 0 前言 电子激发的研究是 最重要的研究领域之一。波函数分析...

本文的实例操作部分有视频演示，见：https://www.bilibili.com/video/av35812201/ 使用Multiwfn绘制跃迁密度矩阵和电荷转移矩阵考察电子激发特征 Using Multiwfn to plot transition density matrix and charge transfer matrix to investigate electron excitation characteristics ...

用于非限制性开壳层波函数的双正交化方法的原理与应用 Principle and application of biorthogonalization method for unrestricted open-shell wavefunctions 文/Sobereva@北京科音 First release: 2018-Nov-11   Last update: 2021-Sep-10 摘要：本文非常简要地...

注1：本文有完整的演示视频，初学者严格照着操作！5分钟内不可能学不会！https://www.bilibili.com/video/av34024335/ （别说字太小看不清楚，登录后看1080p的，不可能看不清楚） 注2：在本文的基础上，通过修改材质和恰当使用Tachyon渲染器，可以得到效果远胜于本文的轨道等值面图，务必在看过本文后一看：《用VMD绘制艺术级轨道等值面图的方法（含演示视频）》（//www.umsyar.com/449） 使用Mu...

2018年10月完结动画简评 文/Sobereva  2018-Oct-16 本文是笔者完整观看过的2018年10月完结的24部全长TV版动画和5部泡面番的简评。注意其中多多少少有一些剧透的成份，怕被剧透又想了解哪些值得追的话就看评分就好了。所有新番笔者都看过前几话（扫番过程的粗略观感在http://bbs.keinsci.com/forum-68-1.html里的相应帖子里写了），没追的要么是笔者对其题材有抗拒（比如恐怖或者胡搞类），要么...

注：本文有对应的演示视频，必看！见https://www.bilibili.com/video/av33733749/ 凡是按照本文的详细说明还绘制不出来的人，一定要精确严格重复视频里的操作！应先把视频里的示例体系重复一遍，连这个例子都重复不出来者注意看本文文末的文字 使用Multiwfn+VMD快速地绘制静电势着色的分子范德华表面图和分子间穿透图 Using Multiwfn+VMD to rapidly plot elec...