注:笔者后来又写了《使用Multiwfn计算轨道的体积》(//www.umsyar.com/734),和本文内容有一些相关性,推荐看完本文后阅读。
通过轨道离域指数(ODI)衡量轨道的空间离域程度
Using orbital delocalization index (ODI) to measure spatial delocalization extent of orbitals
文/Sobereva@北京科音
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后记:后来笔者在此文的研究的基础上做了大量扩展和深化,发表了一系列论文,并且还做了很多其它的与18碳环及其类似物有关的研究,汇总见//www.umsyar.com/carbon_ring.html。非常欢迎阅读和引用其中的文章!
一篇最全面、系统的研究新颖独特的18碳环的理论文章
The most comprehensive and systematic theoretical article on the novel and uni...
将Multiwfn计算的键级直接标注在分子结构图上的方法
The way of directly labelling bond orders calculated by Multiwfn on molecular structure map
文/Sobereva@北京科音 2019-Dec-4
有人在Multiwfn中文论坛上问怎么把Multiwfn计算的键级直接标注在分子结构图上,以便于直观观看。将Multiwfn...
计算分子内氢键键能的几种方法
Several methods for calculating energy of intramolecular hydrogen bonds
文/Sobereva@北京科音
First release: 2019-Nov-23 Last update: 2022-May-26
0 前言
计算分子间弱相互作用,包括计算最常被研究的氢键的键能,已经有非常成熟、准确的方法,比如最常用的就是...
Grimme的xtb程序的编译方法
Compilation method of Grimme's xtb program
文/Sobereva@北京科音 2019-Nov-21
之前笔者在《将Gaussian与Grimme的xtb程序联用搜索过渡态、产生IRC、做振动分析》(//www.umsyar.com/421)中已经对xtb程序的基本情况进行了介绍,也说明了安装方法。通常直接用预编译版的xtb就够了,但有...
2020-Sep-14后记:本文中关于多中心键级计算耗时的说法已经完全过时了。因为从2020-Sep-12更新的Multiwfn开始,程序中实现了笔者提出的一种超快的多中心键级计算算法,而精度没有丝毫损失,对于哪怕含有几十个原子的环也可以非常快速地计算多中心键级,这使得多中心键级的应用范畴有了革命性的扩展。相比之下,AV1245的实际价值就已经不大了。
使用Multiwfn计算AV1245指数研究大环的芳香性
Using Multiwfn ...
谈谈如何衡量分子的极性
The way of measuring molecular polarity
文/Sobereva@北京科音
First release: 2019-Oct-16 Last update: 2020-Sep-29
0 前言
经常有人问怎么衡量分子的极性,是不是算个偶极矩就可以。实际上,极性是一个非常含糊的概念。从本质上来说,极性来自于净电荷分布的不均匀性,不均匀性越大则极性越...
注:读者务必使用目前Multiwfn官网上的最新版本,早期版本Multiwfn有某些bug
将Gaussian等程序收敛的波函数作为ORCA的初猜波函数的方法
The method of using the converged wavefunction of Gaussian or other program as the initial guess wavefunction of ORCA
文/Sobereva@北京科音
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关于为什么Multiwfn算的出RESP电荷与Antechamber的有所差异
Regarding why the RESP charge calculated by Multiwfn is different from that of Antechamber
文/Sobereva@北京科音 2019-Sep-27
0 前言
RESP电荷的原理、细节以及计算在《RESP拟合静电势电荷的原理以及在Multiwfn中的计算》(ht...
注:笔者后来又写了《使用Multiwfn通过局部电子附着能(LEAE)考察亲核反应位点、难易及弱相互作用》(//www.umsyar.com/676),其中介绍的重要的LEAE函数与ALIE有关键性的互补,非常推荐阅读!
使用Multiwfn和VMD绘制平均局部离子化能(ALIE)着色的分子表面图(含视频演示)
Using Multiwfn and VMD to plot map of molecular surface colore...
透彻认识氢键本质、简单可靠地估计氢键强度:一篇2019年JCC上的重要研究文章介绍
Thoroughly understanding the nature of hydrogen bonds and estimating hydrogen bond strength easily and reliably: An introduction to an important research article published in JCC in the 2019
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使用Multiwfn对第一超极化率做双能级和三能级模型分析
Using Multiwfn to perform two-level and three-level model analyses for first hyperpolarizability
文/Sobereva@北京科音
First release: 2019-Sep-6 Last update: 2023-Aug-11
1 前言
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谈谈怎么正确认识论文投稿时对图像分辨率的要求
On the correctly understanding the requirements for image resolution when submitting a paper
文/Sobereva@北京科音 2019-Aug-31
笔者在思想家公社QQ群和计算化学公社论坛交流、答疑时,时常看到有人提到有关图片的分辨率的问题,一些期刊在投稿时对分辨率有明确要求。...