Grimme的xtb程序的编译方法

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Grimme的xtb程序的编译方法

Compilation method of Grimme's xtb program

文/Sobereva@北京科音2019-Nov-21


之前笔者在《将Gaussian与Grimme的xtb程序联用搜索过渡态、产生IRC、做振动分析》（//www.umsyar.com/421）中已经对xtb程序的基本情况进行了介绍，也说明了安装方法。通常直接用预编译版的xtb就够了，但有时候为实现特殊目的需要改代码，这就需要自己编译了。本文介绍一下在CentOS 7.4下的编译。机子里已经装了ifort+icc 19.0.1.144编译器。xtb用的是https://github.com/grimme-lab/xtb/releases下载的6.2.1版。对于其它操作系统、其它版本xtb的情况请根据实际提示随机应变。

先安装Python 3：
yum install python3
这会把pip3也装上。

之后运行以下命令把meson和ninja都装上，这俩是干什么的参考《DFT-D4色散校正的简介与使用》（//www.umsyar.com/464）里的说明。
pip3 install meson
yum install ninja-build
（注：虽然yum install meson也可以装meson，但源里面的版本太老，而xtb 6.2.1要求必须版本>=0.49，因此用pip3来装）

将xtb的源代码包解压，打开此目录下的meson.build，在
## ========================================== ##
## LIBRARIES
部分的前头一行加上
add_project_link_arguments('-L/usr/lib/x86_64-redhat-linux6E/lib64/', language: 'c')
否则在链接可执行文件时可能会提示找不到库文件。

之后在xtb目录下运行
export FC=ifort CC=icc CXX=icpc
meson setup build_intel --optimization=2
ninja -C build_intel

编译过程不到10分钟，中途如果卡着不动，屏幕上提示dep hack，不要着急，慢慢等着即可。

编译完了之后在build_intel目录下就会看到xtb可执行文件。将之挪到xtb可执行文件包里覆盖原有的可执行文件即可。

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