使用Multiwfn计算激发态之间的密度差

使用Multiwfn计算激发态之间的密度差

Using Multiwfn to calculation electron density difference between excited states

文/Sobereva @北京科音

First release: 2018-Jul-28 Last update: 2022-Jul-14


1 前言

使用Multiwfn计算密度差、绘制各种密度差图形非常简单,在《使用Multiwfn作电子密度差图》(//www.umsyar.com/113)中有充分示例,其中也包括绘制激发态与基态间的密度差,这对于讨论电子跃迁过程中的电子转移特征很有意义。对Multiwfn稍有了解的人肯定也都明白,通过Multiwfn同样也可以绘制激发态之间的密度差,只要让Gaussian等量化程序输出记录了相应两个激发态的波函数的文件,然后按照常规步骤绘制密度差即可。

但是,有时由于特殊需要,我们要对一大批激发态两两之间计算密度差,如果用 程序对每个激发态都做一次计算来产生记录了其波函数的文件,显然是很繁琐的事情;即便可以用脚本自动化实现,但总耗时也比只做一次电子激发计算高很多。好在Multiwfn可以读取Gaussian等程序的激发态计算任务的输出文件,一次性就能把各个激发态的.mwfn文件全都产生出来。.mwfn是Multiwfn支持的记录波函数信息的一种格式,见《详谈Multiwfn支持的输入文件类型、产生方法以及相互转换》(//www.umsyar.com/379),对于TDDFT等方法计算的激发态,这样得到的.mwfn文件里记录的是激发态的自然轨道。之后想对哪两个激发态之间绘制密度差就利用哪两个态的.mwfn文件即可,非常方便,本文就结合Gaussian示例一下操作。更多关于此功能的说明可参见Multiwfn手册3.21.13节。

另外,有了激发态的.mwfn文件后,将之载入Multiwfn后还可以对激发态做各种波函数分析,比如计算电荷分布、键级等等,分析实例可参看《在Multiwfn中基于fch产生自然轨道的方法与激发态波函数、自旋自然轨道分析实例》(//www.umsyar.com/403)等文章。

Multiwfn可以从其主页//www.umsyar.com/multiwfn上免费下载,不了解Multiwfn的读者建议参看《Multiwfn入门tips》(//www.umsyar.com/167)和《Multiwfn波函数分析程序的意义、功能与用途》(//www.umsyar.com/184)。Gaussian用的是G16W A.03。本文涉及的文件可在此下载:file.zip


2 实例:绘制N-苯基吡咯的激发态之间的密度差

首先使用以下输入文件,在PBE0/6-31G*级别下做TDDFT计算,得到最低五个单重态激发态的信息。IOp(9/40=4)是为了让Gaussian输出所有绝对值大于1E-4的组态系数,这些组态系数连同基态分子轨道将被用于构建激发态自然轨道。不写IOp(9/40=4)的话,默认情况下只输出绝对值大于0.1的组态系数,此时Multiwfn产生的激发态自然轨道将很不准确。

%chk=C:\N-phenylpyrrole.chk
# PBE1PBE/6-31g(d) TD(nstates=5) IOp(9/40=4)

B3LYP/6-31G* opted

0 1
C -0.00000000 1.12162908 1.82507914
C -0.00000000 0.71310006 3.13457424
C -0.00000000 -0.71310006 3.13457424
C -0.00000000 -1.12162908 1.82507914
N -0.00000000 0.00000000 1.00627307
H -0.00000000 2.11821416 1.41565311
H -0.00000000 1.36582111 3.99707730
H -0.00000000 -1.36582111 3.99707730
H -0.00000000 -2.11821416 1.41565311
C 0.00000000 -0.00000000 -0.41287403
C 0.00000000 -1.20626109 -1.13056908
C 0.00000000 1.20626109 -1.13056908
C 0.00000000 -1.20041809 -2.52387419
H 0.00000000 -2.15723816 -0.61186005
C 0.00000000 1.20041809 -2.52387419
H 0.00000000 2.15723816 -0.61186005
C 0.00000000 -0.00000000 -3.23381724
H 0.00000000 -2.14896316 -3.05414223
H 0.00000000 2.14896316 -3.05414223
H 0.00000000 -0.00000000 -4.31975533

将得到的chk用formchk转换为fch文件。然后启动Multiwfn,依次输入

N-phenylpyrrole.fch //刚得到的fch文件。里面记录的是基态的DFT轨道
18 //电子激发分析
13 //产生激发态的.mwfn文件
N-phenylpyrrole.out //刚得到的输出文件
1-3 //假设当前我们只需要产生前三个激发态的.mwfn文件
马上,当前目录下就产生了NO_0001.mwfn、NO_0002.mwfn、NO_0003.mwfn,分别是记录了第1、2、3激发态自然轨道的.mwfn文件。

假设我们目前想考察第3激发态(S3)与第1激发态(S1)之间的密度差的等值面图,就重启Multiwfn,然后输入
NO_0003.mwfn
5 //计算格点数据
0 //自定义操作
1 //之后有一个文件会作用到一开始载入的文件上
-,NO_0001.mwfn //令NO_0003.mwfn的属性减去NO_0001.mwfn的属性
1 //属性设为电子密度
2 //中等质量格点
-1 //观看等值面图
在图形窗口中把等值面数值设小到0.005,看到下图。绿色区域为正,蓝色区域为负,分别代表S3比S1密度多和少的区域。

实际上之后还可以做更多的分析,比如可以按照手册4.13.6节示例的将密度差转化为电荷位移曲线、按照手册4.18.3节示例的将密度差的正、负部分平滑化为高斯分布并计算电荷转移长度等等,这里就不再多述了。

Multiwfn如上方式产生的激发态的.mwfn文件对应的是非弛豫的激发态密度,这没有弛豫的激发态密度那么真实,但好处是不需要额外耗时。如果非要用弛豫的激发态密度来求差,那就不得不对每个激发态分别做计算来产生波函数文件了,而且每次耗时和计算激发态能量梯度的耗时相仿佛,故代价较高。使用比如# PBE1PBE/6-31g(d) TD(nstates=5,root=3) out=wfn关键词所产生的.wfn文件记录的就是第3激发态的弛豫密度对应的自然轨道。关于弛豫和非弛豫密度的更多信息见http://bbs.keinsci.com/thread-5738-1-1.html

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